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| 国立公文書館つくば分館 | 防災科学技術研究所 |
| 図書館情報大学 | 国土地理院 |
| 筑波大学 | 土木研究所 |
| 筑波技術短期大学 | 建築研究所 |
| 高エネルギー加速器研究機構 | ＮＴＴアクセスサービスシステム研究所 |
| 国立科学博物館筑波研究資料センター | 理工系機関 |
| 国際協力事業団筑波国際センター | 金属材料技術研究所 |
| 国立教育会館学校教育研修所 | 無機材質研究所 |
| 生物系機関 | 国立環境研究所 |
| 理化学研究所筑波研究所 | 工業技術院総務部筑波研究支援総合事務所 |
国立感染症研究所筑波医学
実験用霊長類センター | 産業技術融合領域研究所 |
国立医薬品食品衛生研究所
筑波薬用植物栽培試験場 | 計量研究所 |
| 種苗管理センター | 物質工学工業技術研究所 |
| 農林水産技術会議事務局筑波事務所 | 生命工学工業技術研究所 |
| 農業研究センター | 地質調査所 |
| 農業生物資源研究所 | 電子技術総合研究所 |
| 農業環境技術研究所 | 機械技術研究所 |
| 畜産試験場 | 資源環境技術総合研究所 |
| 果樹試験場 | 気象測器検定試験センター |
| 農業工学研究所 | 気象研究所 |
| 蚕糸・昆虫農業技術研究所 | 高層気象台 |
| 家畜衛生試験場 | 宇宙開発事業団筑波宇宙センター |
| 食品総合研究所 | 共同利用系機関 |
| 国際農林水産業研究センター | 研究交流センター |
| 森林総合研究所 | |
| 市内立地の民間研究機関 |
| 青木建設研究所 | （株）長大総合研究所 |
| オムロン（株） | ツクバ技研（株） |
| (株)神戸製鋼所技術開発本部筑波研究所 | （株）トーキン商品開発研究所 |
| 三洋電気（株）研究開発本部筑波研究所 | 東洋インキ製造（株）筑波研究所 |
| 住友化学工業（株）筑波研究所 | (株)トクヤマつくば研究所 |
| ダイキン工業（株）mec研究所 | 戸田建設（株）技術研究所 |
| （株）つくば研究コンソーシアム | 日本板硝子(株)技術研究所筑波研究センター |
| （株）つくば研究支援センター | （株）日本触媒筑波研究所 |
| （株）テキサスインスツルメンツ筑波研究開発センター | 日本電気(nec)（株）筑波研究所 |
| （株）間技術研究所 | 日本ハム（株）中央研究所 |
| 三菱電機（株）開発本部筑波事業所 | 浜松ホトニクス（株）筑波研究所 |
| 山之内製薬(株)筑波研究センター | 萬有製薬(株)つくば研究所 |
| 上野製薬(株)つくば食品技術研究所 | 日立化成工業（株）筑波開発研究所 |
| エーザイ(株)筑波研究所 | ホソカワミクロン（株）つくば粉体技術開発センター |
| (株)奥村組技術研究所 | 保土ヶ谷化学工業（株）筑波研究所 |
| 協和発酵工業(株)筑波研究所 | 三菱ガス化学（株）総合研究所 |
| (株)熊谷組技術研究所 | ロレアル筑波センター |
| 興和(株)興和総合科学研究所 | (株)島津製作所基盤技術研究所つくば技術センター |
| ダイセル化学工業（株）筑波研究所 | 日特建設(株)技術本部筑波研究所 |
| 武田薬品工業（株）筑波リサーチセンター | (株)日本紙パルプ研究所 |
| 公益法人 |
| (社)科学技術国際交流センター |
| (財)国際科学振興財団 |
| (財)全日本地域研究交流協会 |
| 全国農業協同組合連合会(JA全農) |
| 飼料畜産中央研究所 |
| (財)つくば科学万博記念財団 |
| 常設展示施設:つくばエキスポセンター |
| (財)つくば都市交通センター |
| (財)つくば都市振興財団 |
| (社)日本建設機械化協会建設機械化研究所筑波支所 |
| (財)日本自動車研究所 |
| (財)日本農業研究所実験農場 |
| (社)農林水産先端技術産業振興センター |
| 農林水産先端技術研究所 |
| ベターリビング筑波建設試験センター |
| 東京家政学院筑波女子大学(学校法人) |
| 教育機関 |
| 筑波大学 |
| 図書館情報大学 |
| 筑波技術短期大学 |
| 東京家政学院筑波女子大学 |
| 県立つくば看護専門学校 |
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